Projekt Gospodarsko-socialni položaj prebivalstva na Slovenskem na prehodu iz fevdalizma v kapitalizem Trajanje projekta: 1. februar 2008–30. januar 2011 Šifra: J6-0093 (B)
Projekt Arhivski viri za urabnistično in arhitekturno zgodovino na Slovenskem (16.–19. stoletje) Trajanje projekta: 1. februar 2008–30. januar 2011 Vodja projekta: dr. Metoda Kemperl Šifra: J6-0622 (B)
Projekt Neznani rokopisi slovenskega slovstva 17. in 18. stoletja: informacijsko-tehnološko podprta evidenca, znanstvene objave in analize Trajanje projekta: 1. februar 2008–30. januar 2011 Šifra: L6-0163 (B)
Projekt Srednjeveška in novoveška pisna dediščina na Slovenskem – edicije listin Trajanje projekta: 1. januar 2007–31. december 2009 Šifra: J6-9167 (B)
Projekt Vojaki iz slovenskega prostora na tujih tleh v preteklosti Trajanje projekta: 1. junij 2006–31. maj 2008 Vodja projekta: dr. Stane Granda Šifra: M6-0172 (B)
Projekt Vojaško-civilni odnosi v Sloveniji med obema vojnama Trajanje projekta: 1. junij 2006–30. november 2007 Vodja projekta: dr. Jurij Perovšek Šifra: M6-0180 (B)
Projekt Stalnice in prelomi v zgodovini slovenskega prostora Trajanje projekta: 1. september 2005–31. avgust 2008 Vodja projekta: ddr. Igor Grdina Šifra: J6-7002 (B)
Projekt Slovenska vojska. Kratka zgodovina – dolga tradicija? Trajanje projekta: 1. avgust 2004–31. avgust 2006 Vodja projekta: dr. Petra Svoljšak
Projekt Življenje in delo pomembnih osebnosti severovzhodne Slovenije Trajanje projekta: 1. julij 2004–30. junij 2007 Vodja projekta: dr. Andrej Vovko Šifra: L6-6110 (B)
Projekt Preoblikovanje spomina - Propaganda in komemoracija kot sestavni del 1. svetovne vojne Trajanje projekta: 1. julij 2004–30. junij 2007 Šifra: J6-6094 (B)