Matjaž Bizjak je raziskovalec na Zgodovinskem inštitutu Milka Kosa ZRC SAZU, kjer se posveča preučevanju in ediranju srednjeveških zgodovinskih virov in historično-topografskim raziskavam. Doktoriral je iz zgodovinskih znanosti na Filozofski fakulteti Univerze v Ljubljani, opravil je tudi Masters of Arts program iz medievistike na Central European University v Budimpešti.
V okviru svojih raziskav se najraje loteva tekstno-kritičnih edicij srednjeveških virov, predvsem listin, urbarjev in obračunske dokumentacije ter podrobnih študij ožjih zgodovinskih problemov.
Glavno raziskovalno področje Matjaža Bizjaka so temeljne raziskave zgodovinskih virov. Osredotoča se na evidentiranje, evalviranje in objavljanje srednjeveških pravnih in administrativnih dokumentov za ozemlje Slovenije.
Med njegove pomembnejše dosežke sodijo znanstveni monografiji »Ratio facta est« in »Rodbina Gall in njene veje v srednjem veku« ter tekstno-kritične edicije virov, med njimi še posebej »Urbarji briksenske škofije 1253-1464«, »Deželnoknežji obračuni za Kranjsko 1436-1448« in »Turjaška knjiga Listin I in II« (zadnji v soavtorstvu z Miho Preinfalkom). Kontinuirano sodeluje v nacionalnih znanstveno-raziskovalnih projektih, v zadnjem desetletju kot nosilec obsežnega večetapnega projekta »Slovenska historična topografija«, obenem se posveča nadgradnji »Centralne kartoteke srednjeveških listin za Slovenijo« pokojnega Boža Otorepca. Zaključek obeh zadnjeomenjenih projektov predstavlja njegov glavni raziskovalni cilj.
- Ratio facta est : gospodarska struktura in poslovanje poznosrednjeveških gospostev na Slovenskem, Matjaž Bizjak, 2003.
- Die geschichtlichen Beziehungen slowenischer Länder zu Bayern im 15. Jahrhundert unter besonderer Berücksictigung des Hochstifts Freising, Matjaž Bizjak,2003.
- Srednjeveški obračuni freisinške škofije = Die mittelalterlichen Abrechnungen des Hochstifts Freising. Del 1, Obračuni gospostev Škofja Loka in Klevevž 1395-1401 = 1. Teil - Abrechnungen der Herrschaften Škofja Loka und Klevevž 1395-1401, Matjaž Bizjak, 2005
- Razvoj, uprava in poslovanje freisinške in briksenske posesti na Kranjskem v srednjem veku, Matjaž Bizjak, 2005.
- Srednjeveški urbarji za Slovenijo. 5, Urbarji briksenske škofije, = (Die Urbare des Hochstifts Brixen) : 1253-1464, Matjaž Bizjak, 2006.
- Turjaška knjiga listin. 1, Listine zasebnih arhivov Kranjske grofovske in knežje linije Turjaških (Auerspergov), Matjaž Bizjak, 2008–.
- Turjaška knjiga listin. 2, Dokumenti 15. stoletja, Matjaž Bizjak, Miha Preinfalk. 2009. Ljubljana: Založba ZRC
- Knjiga obračunov celjskih mestnih sodnikov : 1457-1513, Matjaž BIZJAK, 2010.
- Listina o izgradnji in posvetitvi lastniške cerkve v Lescah. Matjaž Bizjak, 2012.
- Dipold IV. Katzensteinski v službi Ludvika V. Brandenburškega, Matjaž Bizjak, 2015.
- Srednjeveške računske knjige za Slovenijo. 1, Deželnoknežji obračuni za Kranjsko, = (Landesfürstliche Abrechnungen für Krain) : 1436-1448, Matjaž Bizjak, 2016.
- Marginalije h genealogiji svobodnih gospodov Žovneških, Matjaž Bizjak, 2018.
- Rodbina Gall in njene veje v srednjem veku, Matjaž Bizjak, 2019.
- Omembe cenzualov v listinskem gradivu za ozemlje Slovenije. Matjaž Bizjak, 2019.
- Historična topografija Posavinja in Posotelja (aplikativni raziskovalni projekt • 01. oktober 2022 - 30. september 2025)
- Toponomastična dediščina Primorske (aplikativni raziskovalni projekt • 01. julij 2018 - 30. junij 2021)
- Temeljne raziskave slovenske kulturne preteklosti (raziskovalni program • 01. januar 2015 - 31. december 2021)
- Slovenski toponimi v času in prostoru (Historična topografija Slovenije od srednjega veka do 19. stoletja) (temeljni raziskovalni projekt • 01. julij 2011 - 30. junij 2014)
- Vojaki iz slovenskega prostora na tujih tleh v preteklosti (temeljni raziskovalni projekt • 01. junij 2006 - 31. maj 2008)
- Stalnice in prelomi v zgodovini slovenskega prostora (temeljni raziskovalni projekt • 01. september 2005 - 31. avgust 2008)
- Elenchus fontium historiae Slovenicae urbanae. – Objava izbora virov za slovensko urbano zgodovino (temeljni raziskovalni projekt • 01. februar 2008 - 30. januar 2011)
- Srednjeveška in novoveška pisna dediščina na Slovenskem – edicije listin (temeljni raziskovalni projekt • 01. januar 2007 - 31. december 2009)
- Človek, narava in okolje med severnim Jadranom in vzhodnimi Alpami v predmodernih obdobjih (temeljni raziskovalni projekt • 01. julij 2011 - 30. junij 2014)
- 2004 - Nagrada KLIO Zveze zgodovinskih društev Slovenije za najboljše raziskovalno delo v zgodovinopisju 2003–2004.
- 2010 - Aškerčevo priznanje Arhivskega društva Slovenije za leto 2010.